调查发现免费工具简化了癌症研究

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摘要:

每个细胞都含有大量的蛋白质,每种蛋白质都有特定的功能,例如充当另一种分子的受体或催化化学反应的酶。这种机制的紊乱会严重影响细胞,引起疾病,比如癌症,其中患病细胞的功能与健康细胞的功能有着根本的不同。因此,*物以蛋白质为目标是非常常见的,这将抑制或刺激其产生或吸收。

同时,有许多已批准的*物对某些疾病有被证实的效果,但没有已知的蛋白质靶点。据说这种物质的作用机制完全或部分未知。

因此,科学家们有兴趣开发一种相对简单的方法来确定哪种蛋白质受到某种*物的影响。这些方法中的一些是可用的,但是它们都有缺点。卡罗林斯卡学院的研究人员现在已经使用这些方法创造了一种新的工具,可以提供更可靠和准确的结果。

研究人员通过对用56种不同*物治疗的肺癌细胞进行实验来开发他们的方法。对于每种*物,他们首先计算48小时后杀死一半细胞的剂量(LC50),然后将该剂量用于所有*物。一旦有一半细胞死亡,他们会检查每个细胞的蛋白质组(即存在什么蛋白质及其丰度),以确定*物靶向的蛋白质。

在进一步的实验中,他们在乳腺癌和肠道肿瘤的其他细胞上测试了该*物,并得出结论,该*物在靶向癌细胞方面具有特异性或普遍性。

这些实验的结果在研究人员创建的可搜索数据库中有描述(见下面的链接),方法本身在《自然通讯》发表的文章中有详细描述。这个想法是,其他研究人员可以使用相同的模型对其他*物进行类似的实验,从而扩大更多目标蛋白的更多物质的数据库。

卡罗林斯卡医学院医学蛋白质基因组学教授罗曼祖巴列夫说:“我们发现不同的*物以不同的方式杀死细胞。”“不久前,我们认为细胞只能以三种方式死亡——坏死、凋亡或自噬——但现在我们观察到了至少十三种不同的细胞死亡方式。这种方法可以帮助加速某些部分的新*开发,或者增强我们对现有*物的了解。”

标签:癌症研究
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